Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CASC2Q6XLA1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CASC2Q6XLA1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CASC2Q6XLA1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CASC2Q6XLA1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CASC2Q6XLA1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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