Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUSD1Q6UWL2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms