Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC1Q6TDU7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms