Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms