Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZCCHC12Q6PEW1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms