Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf135Q5VTT2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms