Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms