Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND3Q5T5X7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms