Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms