Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms