Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6CQ53S08 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms