Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A12Q504Y0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms