Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms