Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms