Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms