Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSPP1Q1MSJ5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSPP1Q1MSJ5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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