Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC142Q17RM4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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