Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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