Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms