Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms