Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PDK4Q16654 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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