Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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