Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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