Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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