Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
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