Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EEA1Q15075 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
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EEA1Q15075 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
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EEA1Q15075 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
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