Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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