Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NWD1Q149M9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NWD1Q149M9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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