Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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GPNMBQ14956 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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