Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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