Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms