Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RRP1BQ14684 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RRP1BQ14684 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RRP1BQ14684 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RRP1BQ14684 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RRP1BQ14684 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRP1BQ14684 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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