Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSC3Q14574 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms