Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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GBX1Q14549 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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