Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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VGLL4Q14135 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VGLL4Q14135 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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