Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
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