Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms