Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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