Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DDX39BQ13838 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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