Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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