Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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