Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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