Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
STRN3Q13033 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms