Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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