Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NFIAQ12857 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NFIAQ12857 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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NFIAQ12857 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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NFIAQ12857 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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NFIAQ12857 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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