Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF5Q12774 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
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