Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms