Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms