Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms