Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms